Ce sous-projet est principalement axé sur la protection des eaux de la Wieslauter contre la pollution. La pollution des cours d'eau par des substances externes menace la biodiversité aquatique (sous-projet 2) : ces substances apportent par exemple un excès de nutriments et de pesticides provenant de l'agriculture. Outre les différentes sources d'apport (ponctuelles, par exemple les stations d'épuration, ou diffuses, par exemple l’activité agricole), les pollutions par des substances sont en outre contrôlées par la dynamique des débits (étiages et pics de débit). L’apparition de phénomènes météorologiques extrêmes devenant de plus en plus probable avec l’aggravement du changement climatique, la gestion des eaux de la Wieslauter doit être adaptée en tenant compte des futurs scénarios de changement climatique et d'utilisation des sols (sous-projet 1). L’objectif de ce sous-projet est donc de développer une politique transfrontalière de gestion de la Wieslauter, en coopération avec les utilisateurs locaux. Les stratégies, les solutions et le plan d'action élaborés dans le cadre du projet doivent permettre aux utilisateurs de réagir de manière adaptée aux événements météorologiques extrêmes à court terme et de mettre en œuvre des mesures à moyen et long terme pour réduire la pollution de la Wieslauter par les substances externes (sous-projet 4). Tous les instruments et stratégies seront élaborés sur la base de l’exemple de la Lauter/Wieslauter et seront complétés par des recommandations d’ordre général à l’échelle de la RMT.